Der Kern des BIGS ist ein klassischer Think Tank, in dem wissenschaftliche Mitarbeiter mit unterschiedlichem disziplinären und institutionellen Hintergrund an gesellschaftlich relevanten Fragen der zivilen Sicherheit arbeiten. Hierzu erstellen sie Analysen und Empfehlungen über Gefahrenpotenziale, Vermeidungs- und Bekämpfungsstrategien, den Markt für Sicherheitstechnologien und -dienstleistungen, identifizieren institutionellen Veränderungsbedarf und entwerfen Szenarien als Grundlage für die Vorbereitung auf den Ernstfall. Dabei soll eng mit den Anbietern und Nachfragern, aber auch mit Kritikern von Konzepten ziviler Sicherheit kooperiert werden, um die gesellschaftliche Relevanz der Forschung sicherzustellen. Dabei geht es auch um die Zusammenhänge zwischen der Produktion sozialer Sicherheit und der sozialen Kontrolle sowie möglicher Diskriminierungen sozialer Gruppen. Im Vordergrund steht die ganzheitliche Perspektive auf die Chancen und auf die Risiken von Sicherheitskonzepten und -technologien.
Durch ein „Denken auf Vorrat“ will das BIGS den Beitrag erhöhen, den die Wissenschaft dazu leisten kann, Katastrophen und Angriffe abzuwenden, ihre Schadenshöhe zu begrenzen sowie eine zügige Wiederherstellung des status quo ante unter Bewahrung der freiheitlich-demokratischen Grundordnung unserer Gesellschaft sicherzustellen.

Das BIGS soll der Legislative, der Exekutive und der Wirtschaft sowie den Medien und gesellschaftspolitisch engagierten Institutionen (z. B. politischen Stiftungen) als Gesprächspartner und Berater zur Verfügung stehen und die öffentliche Diskussion um die Bekämpfung des Terrorismus und anderer Risiken für die öffentliche Sicherheit durch fachkundige Stellungnahmen unterstützen.
Die am BIGS gewonnenen Erkenntnisse, sowie jene von anderen in diesem Feld wissenschaftlich arbeitenden Institutionen aus dem In- und Ausland, sollen an die Fachöffentlichkeit vermittelt werden, ein gesellschaftspolitischer Diskurs angeregt und die wissenschaftliche Lehre an der Universität Potsdam hierdurch bereichert werden. Zu diesem Zwecke wird das BIGS sich in das internationale Netzwerk im Bereich Homeland Security arbeitender Think Tanks einbringen, um auch von deren Erkenntnissen zu profitieren und selbst die Diskussion mit eigenen Arbeiten zu bereichern.
Das BIGS bietet Graduierten unterschiedlicher Disziplinen an, sich wissenschaftlich weiterzubilden und dabei in einen engen Kontakt mit den Nutzern ihrer Erkenntnisse zu treten. Umgekehrt sollen Praktiker aus Wirtschaft und Verwaltung am BIGS die Möglichkeit erhalten, sich für einige Zeit grundsätzlicher mit einem Thema der zivilen Sicherheit zu befassen, um mit neuen Einsichten ihr herkömmliches Arbeitsumfeld in Wirtschaft und Verwaltung zu erweitern. Zugleich sollen die wissenschaftlichen Mitarbeiter am BIGS die Lehre im postgradualen Bereich der Universität Potsdam bereichern. Kurzfristig soll dies durch Ringvorlesungen und Seminare erfolgen. Mittelfristig ist das Angebot eines Vertiefungsgebiets „Zivile Sicherheit“ mit Hilfe des Instituts geplant.
Das BIGS wird geleitet von einem Direktorium. Die strategische Steuerung erfolgt durch einen Beirat, der sich aus Vertretern der Gesellschafter und aus Fachwissenschaftlern sowie anderen Experten der zivilen Sicherheit zusammensetzt. Die Gesellschafter bilden einen Verwaltungsbeirat für die finanziellen und gesellschaftsrechtlichen Angelegenheiten.

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